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如何建立一个PCR实验室
日期:2017-10-22 10:40:00 信息来源:
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为了对以个特定序列进行PCR做重复检测,需求三个不同的区域,每一个区域的具体技术操作和试剂在下面详细列出.

1、样品预备区

 这个区域专门用作样品的预备,在制备和操作用于核酸提取的试剂时应该采取预防措施:

1PCR产品和带有要扩增序列的DNA克隆不能在这个房间操作。

2)组织培养物、组织标本和血清样品都带进样品预备间处理,以依据应用的需求提取DNARNA

3)用于样品处理的东西不能被用作普通分子克隆的东西,也不能用作操作靶序列。

4DNA样品应该用有专门的防护或正压活塞式移液管操作,以避免在汲取样品时有气溶胶遗留。

5)大体积样品应该用单独包装的无菌一次性移液管汲取。

6)管子打开前都要简短离心以减少气溶胶的产生,并且管子不能用力崩开,这样会产生气溶胶。

7)任何时候都应该穿试验服和带手套,手套要经常更换,尤其在抽提过程中每一步之间都要更换。试验服要专门用于样品预备间,经常清洗。

2、样品预备和RNA-PCR 

RNA-PCR的额定步骤需求额定的样品操作,这样增加了样品之间污染的时机。为了避免这一问题,反转录一步能够在样品预备区进行。在RNA-PCR中应用UNG以避免污染的方法也有报导。

3、前PCR

必须有专门用于预备各种反响的区域,这个区域必须保持干净,并且没有来自克隆和样品预备的污染。前PCR区必须要有试剂和预备,特别是专门用于前PCR区的正压活塞式移液管。

4PCR试验室试剂的操作

1)所用的一切溶液都应该没有核酸和(或)核酸酶(DNaseRNase)污染。

2)一切PCR试剂中运用的水都应该是高质量的-新鲜蒸馏的去离子水,用0.22μm过滤的,并且是高压灭菌。

3)在2025贮存的试剂建议加点像叠氮钠一类的抗微生物剂,在扩增试剂或样品制备试剂中加入0。025%的叠氮钠不抑制扩增反响。

4)所用试剂都应该以大体积配制,试验一下看试剂是否满意,然后分装成仅够一次运用的量进行贮存。

5)一切试剂和样品预备过程中都要运用一次性灭菌的瓶子和管子。

6)新配制的试剂在用于预备新的标本之前应该加以检验。

7)样品预备和前PCR区所运用的移液管在不运用时都应该小心保存。

5、在前PCR区建立PCR混合物

1)能够把即刻可用的主混合物溶液配好、分装并保存在-204,在试验室只涉及到扩增一种或少量几种特异序列时这样做很有用。

2)如果你的试验室运用多套引物,以致于配制包含一切试剂的单一反响混合物不够经济,能够考虑分装保存够一天的PCR成分。

3)作为一个规则,应该保存一套阴性、弱阳性和强阳性对照样品来分析样品配制和PCR前过程的效率和洁净程度。并且,你也希望通过运用一个已知的弱阳性样品来验证你的样品缓冲液以证明里面不含扩增抑制物。

4)阴性样品要与每组样品同时做,以分析是否存在样品与样品之间的污染以及是否存在PCR产品的污染,阴性对照应该包含核酸以外的一切试剂。

5)当做阳性对照时,有两个理由决定了应该运用最少量量的核酸。

6)由于必须有对照反响,对照模板的特点应该予以考虑。

6、控制污染的方法

已设计出很有力的酶学方法用来消除一种形式的污染?运用UNG,这一技术能有效地消除由PCR产品引起的污染。另一种控制污染的方法是运用紫外线,这种方法不能完全消除污染问题,但能够将污染降低几个数量级。

7PCR仪的位置

8、后PCR

 PCR完成以后,需求分析样品并解释数据,应该留出一个专门用于反响后处理样品的地方。后PCR活动中运用的所用试剂、一次性耗材和仪器都必须是专门用于这一意图,决不能把试验室这一区域的试剂或仪器用于任何前PCR活动。